L‘esterno può essere suddiviso in tre livelli: absidi e cappelle d’angolo, tetto e presbiterio e cupola. Particolare attenzione è stata posta alla posizione della finestre, studiata in funzione dei dipinti interni con la luce che si diffonde in maniera graduale in tutta la chiesa. Le campate intermedie si trovano leggermente in penombra, l’abside riceve un’illuminazione diffusa ed abbondante, ma è la Cupola che viene colpita dalla luce più intensamente. I bracci che formano la pianta a croce greca sono posti sugli assi cardinali e chiusi da quattro grandi absidi simmetriche, e custodiscono quattro cappelle quadrangolari da sempre destinate al culto. L’interno è ornato da affreschi di scuola parmense del XVII secolo. Il Parmigianino, al quale inizialmente venne affidata l’intera opera pittorica, realizza solo gli affreschi del sottarco orientale. I lavori vennero infatti proseguiti da Michelangelo Anselmi e da Bernardino Gatti. Non meno interessanti sono i lavori di ebanisteria per gli arredi sacri della sagrestia nobile e gli stalli del coro dei cavalieri. Si deve al volere di Maria Luigia d’Austria che, nel 1823, venne realizzata una cripta per conservare i sepolcri dei duchi e dei principi delle case Farnese e Borbone Parma: proprio in memoria della duchessa venne collocato, presso l’ingresso della chiesa, il gruppo con la Pietà di Tommaso Bandini.